Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms