Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms