Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snw1Q9CSN1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms