Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard3bQ9CSB4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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