Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm16286Q9CQX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms