Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arl8bQ9CQW2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arl8bQ9CQW2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms