Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms