Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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