Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med4Q9CQA5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms