Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms