Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms