Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms