Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a6dQ99N07 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms