Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gins4Q99LZ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms