Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms