Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms