Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms