Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms