Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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