Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms