Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims2Q91XD2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms