Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usb1Q91W78 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms