Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csde1Q91W50 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms