Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps3Q91VB4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms