Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms