Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8VDP2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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