Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms