Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolbQ8K409 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms