Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf13Q8K2W6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Phf13Q8K2W6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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