Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc11Q8K2W3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Txndc11Q8K2W3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms