Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms