Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr1eQ8K202 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms