Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nek9Q8K1R7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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