Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snrnp27Q8K194 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snrnp27Q8K194 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Snrnp27Q8K194 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms