Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms