Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CopaQ8CIE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms