Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnka2ipQ8CH19 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms