Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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