Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp27Q8CEG8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp27Q8CEG8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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