Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms