Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R2

Gm3411, Predicted gene 3411, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3411Q8C7R2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3411Q8C7R2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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