Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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