Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C1R3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms