Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms