Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns3Q8BQZ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns3Q8BQZ8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms