Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup93Q8BJ71 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms