Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pknox2Q8BG99 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms