Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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