Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cracr2bQ80ZJ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms