Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms